Bioinformatica
Titel Bioinformatica
Golf golf2
Code nlt2-v115
Domein E
Status gecertificeerd
HAVO/VWO VWO
Beoogd leerjaar
Certificeringsdatum 11-12-2008
Certificeringsnummer 2115-024-VE
Omschrijving Het concept genexpressie (transcriptie, splicing, translatie) wordt vanuit een context benaderd. Hierbij wordt het biologisch concept vertaald naar praktisch digitaal gereedschap. Via de grafische rekenmachine, eenvoudige programmeeropdrachten in java-script en bestaande tools worden beginselen van het lezen van DNA geoefend. In een individuele eindopdracht wordt naar een onbekend gen(product) en de genetische oorzaak van een afwijkend genproduct gezocht.  
Basismateriaal
Context Stefanie is een gezond kind bij geboorte en haar ouders zijn erg blij met hun eerste dochter. Vlak na haar eerste verjaardag merken de ouders echter dat het gedrag van hun dochtertje verandert. Ze heeft geen interesse meer in de speeltjes om haar heen. De artsen vinden na analyse van haar bloed een afwijking in het DNA die het Rett syndroom veroorzaakt. De ouders vragen zich af hoe het komt dat hun oudere zoontje nergens last van heeft. Ze willen ook graag nog een derde kind, maar vragen zich af of het dan mogelijk is om voor de geboorte te weten te komen of het derde kind ook het Rett syndroom zal hebben.
Concepten Transcriptie, translatie, genexpressie, sequentiebepaling, mutatie, toegepast programmeren, wet bench, dry bench.
Vaardigheden Programmeren van grafische rekenmachine en omgaan met Javascript. Biologische kennis vertalen naar een technische vraagstelling om DNA te kunnen lezen.
voorkennis / aansluiting op monovakken

Biologie (genetica) uit klas, ‘computerminded’.

Er is géén onderscheid gemaakt tussen NG en NT profiel in de benadering van de module. Er wordt verwacht dat hoofdstuk 2 daardoor in verschillend tempo zal worden doorlopen.
Structuur Lineair
Leerling-activiteiten Klassikaal, groepswerk, individueel/zelfstandig computergebruik
Faciliteiten
  • Grafische rekenmachine
  • Computers met internet (liefst 1 op 1)
    Toetsvormen en weging

    1. Eindopdracht (2/3)

    2. Proefwerk (1/3)
    Aansluitende modules Verwant: medicijn op maat, medische diagnostiek, forensische technieken
    Ontwikkeld door

    St. Bonifatius College, Utrecht, Frank Holtslag; Stedelijk Gymnasium, Arnhem, Twan van Kessel, Thijs van der Velden; Wageningen Universiteit, Wageningen, Remko Kuipers;  Experts: Wageningen Universiteit, Wageningen, Sonja Isken, Peter Schaap; Hoofdredacteur: Wageningen Universiteit, Wageningen, Janneke van Seters (tot juni 2007), Jeroen Lorier (vanaf juni 2007)

    Belangrijkste monovakken
    BiologieNatuurkundeScheikundeWiskundeAardrijkskundeTechnisch ontwerpen (techniek)
    O O O O 
    Aansluiting bij vervolgopleidingen
    ICT gebruik
    Informatie zoekenVerwerken gegevensMetingen uitvoerenProgrammerenAnders, nl
    O O O O O O 
    Richtbedrag aanschaf materialen Beperkte investering indien computers beschikbaar.
    Moeilijkheidsgraad
    Welke samenwerking extern gewenst?
    Keuzes / verdieping mogelijk
    Contacttijd, zelfstudie en prakticum
    TheorieLabWerkplaatsComputersGymzaalBuitenExtern labContacturenZelfstandig
    O O O O O O O O 
    Aard TOA assistentie / Overige ondersteuning
    BiologieNatuurkundeScheikundeICTOpmerking assistentie techniek
    O O 
    Deskundigheid docenten
    Onderhoud en ondersteuning module (RSP) Wageningen
    Waar is meer informatie te vinden

    Algemeen: www.betavak-nlt.nl
    Voor de NLT docentencommunity: www.kennisnet.nl
    Materiaal voor leerlingen en de NLT toolbox: www.digischool.nl/nlt
    Informatie over e-klassen: www.e-klassen.nl

    Teleblikdossier http://vaklokaal-nlt.nl/?cat=51
    Copyright
    Download status materiaal
    Forum
    Download materialen

    Bioinformatica- leerlingmateriaal - pdf
    gecertificeerde versie 1.0 (pdf, 3 MB)
    Datum: 8 maart 2009
    Bioinformatica- leerlingmateriaal - word
    gecertificeerde versie 1.0 (word, 5,7 MB)
    Datum: 8 maart 2009

    E-klassen modules ( meer info )
    Bioinformatica 
    gecertificeerde versie 1.0-e
    Datum: mei 2010